BARCELONA 17 jul. (EUROPA PRESS) -
Un equip d'investigadors dirigit pel biòleg computacional Frank Supek, de l'Institut de Recerca Biomèdica (IRB) de Barcelona, ha descobert que l'anàlisi de microbiomes humans i altres dades metagenòmiques revelen funcions de gens de microbis, ha informat l'IRB aquest dimarts en un comunicat.
Publicat en la revista 'Microbiome', en l'estudi els investigadors han desenvolupat una metodologia computacional capaç d'examinar milers de metagenomes com els de l'oceà i els del terra al mateix temps i identificar l'evolució de molts gens dels microbis.
La metodologia es basa en un tipus especial d'algorisme d'aprenentatge automàtic que pot generar arbres de decisió per predir funcions genètiques alhora.
En paraules de Supek, el sistema permet que l'algorisme no es confongui amb altres dades metagenòmiques i que pugui "proposar de manera fiable un paper biològic per una gran quantitat de gens de funció desconeguda".
A més, destaca que permet proposar "moltes funcions addicionals pels gens que ja es coneixien", així com detectar el que els genomes no poden mostrar.
Per exemple, Supek explica que els metagenomes de l'oceà poden usar-se per predir quins gens utilitzen els bacteris per la fotosíntesi, mentre que aquest aspecte no es podria haver descobert a partir de bacteris que habiten a l'intestí humà, indica.
Finalment, conclou que els mètodes computacionals com el descobert "estan il·luminant la 'matèria fosca' en genomes microbians".
